Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms