Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
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