Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFE2Q16621 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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