Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SSX1Q16384 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SSX1Q16384 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SSX1Q16384 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SSX1Q16384 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SSX1Q16384 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SSX1Q16384 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SSX1Q16384 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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