Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SF1Q15637 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SF1Q15637 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SF1Q15637 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SF1Q15637 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SF1Q15637 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SF1Q15637 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SF1Q15637 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SF1Q15637 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SF1Q15637 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SF1Q15637 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SF1Q15637 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SF1Q15637 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SF1Q15637 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SF1Q15637 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SF1Q15637 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SF1Q15637 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SF1Q15637 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SF1Q15637 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SF1Q15637 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SF1Q15637 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SF1Q15637 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SF1Q15637 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SF1Q15637 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SF1Q15637 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SF1Q15637 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SF1Q15637 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SF1Q15637 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SF1Q15637 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SF1Q15637 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SF1Q15637 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SF1Q15637 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SF1Q15637 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SF1Q15637 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SF1Q15637 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SF1Q15637 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SF1Q15637 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SF1Q15637 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SF1Q15637 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SF1Q15637 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SF1Q15637 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SF1Q15637 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SF1Q15637 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SF1Q15637 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SF1Q15637 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SF1Q15637 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SF1Q15637 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SF1Q15637 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SF1Q15637 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SF1Q15637 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SF1Q15637 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SF1Q15637 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SF1Q15637 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SF1Q15637 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SF1Q15637 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SF1Q15637 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SF1Q15637 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SF1Q15637 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SF1Q15637 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SF1Q15637 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SF1Q15637 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SF1Q15637 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SF1Q15637 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SF1Q15637 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SF1Q15637 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SF1Q15637 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SF1Q15637 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SF1Q15637 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SF1Q15637 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SF1Q15637 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SF1Q15637 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SF1Q15637 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SF1Q15637 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SF1Q15637 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SF1Q15637 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SF1Q15637 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SF1Q15637 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SF1Q15637 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SF1Q15637 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SF1Q15637 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SF1Q15637 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SF1Q15637 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SF1Q15637 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SF1Q15637 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SF1Q15637 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SF1Q15637 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SF1Q15637 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SF1Q15637 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SF1Q15637 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SF1Q15637 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SF1Q15637 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SF1Q15637 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SF1Q15637 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SF1Q15637 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SF1Q15637 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SF1Q15637 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SF1Q15637 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SF1Q15637 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SF1Q15637 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SF1Q15637 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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