Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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