Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
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ODF1Q14990 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
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ODF1Q14990 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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ODF1Q14990 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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