Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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SQLEQ14534 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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