Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
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