Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms