Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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