Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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HTR4Q13639 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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HTR4Q13639 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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HTR4Q13639 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTR4Q13639 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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