Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

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Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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