Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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