Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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