Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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