Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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