Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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