Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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