Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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