Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms