Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms