Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPN11Q06124 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPN11Q06124 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms