Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms