Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms