Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBBP68871 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms