Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VBP1P61758 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VBP1P61758 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VBP1P61758 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VBP1P61758 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VBP1P61758 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VBP1P61758 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VBP1P61758 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VBP1P61758 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VBP1P61758 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VBP1P61758 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VBP1P61758 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VBP1P61758 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VBP1P61758 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VBP1P61758 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VBP1P61758 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VBP1P61758 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VBP1P61758 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VBP1P61758 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VBP1P61758 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VBP1P61758 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VBP1P61758 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VBP1P61758 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VBP1P61758 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VBP1P61758 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VBP1P61758 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VBP1P61758 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VBP1P61758 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VBP1P61758 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VBP1P61758 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VBP1P61758 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VBP1P61758 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VBP1P61758 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VBP1P61758 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VBP1P61758 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VBP1P61758 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VBP1P61758 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VBP1P61758 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VBP1P61758 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VBP1P61758 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VBP1P61758 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VBP1P61758 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VBP1P61758 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VBP1P61758 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VBP1P61758 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VBP1P61758 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VBP1P61758 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VBP1P61758 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VBP1P61758 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VBP1P61758 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VBP1P61758 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VBP1P61758 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VBP1P61758 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VBP1P61758 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VBP1P61758 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VBP1P61758 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VBP1P61758 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VBP1P61758 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VBP1P61758 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VBP1P61758 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VBP1P61758 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VBP1P61758 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VBP1P61758 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VBP1P61758 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VBP1P61758 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VBP1P61758 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VBP1P61758 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VBP1P61758 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VBP1P61758 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VBP1P61758 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VBP1P61758 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VBP1P61758 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VBP1P61758 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VBP1P61758 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VBP1P61758 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VBP1P61758 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VBP1P61758 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VBP1P61758 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VBP1P61758 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VBP1P61758 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VBP1P61758 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VBP1P61758 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VBP1P61758 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VBP1P61758 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VBP1P61758 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VBP1P61758 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VBP1P61758 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VBP1P61758 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VBP1P61758 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VBP1P61758 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VBP1P61758 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VBP1P61758 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VBP1P61758 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VBP1P61758 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VBP1P61758 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VBP1P61758 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VBP1P61758 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VBP1P61758 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VBP1P61758 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VBP1P61758 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms