Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MCCD1P59942 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MCCD1P59942 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MCCD1P59942 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MCCD1P59942 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
MCCD1P59942 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MCCD1P59942 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
MCCD1P59942 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MCCD1P59942 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MCCD1P59942 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MCCD1P59942 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MCCD1P59942 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCCD1P59942 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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