Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP6P59044 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms