Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP107P57740 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP107P57740 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP107P57740 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP107P57740 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP107P57740 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP107P57740 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP107P57740 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP107P57740 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP107P57740 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP107P57740 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP107P57740 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP107P57740 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP107P57740 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP107P57740 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP107P57740 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP107P57740 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP107P57740 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP107P57740 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP107P57740 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP107P57740 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP107P57740 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP107P57740 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP107P57740 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP107P57740 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP107P57740 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP107P57740 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP107P57740 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP107P57740 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP107P57740 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP107P57740 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP107P57740 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP107P57740 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP107P57740 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP107P57740 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP107P57740 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP107P57740 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP107P57740 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP107P57740 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP107P57740 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP107P57740 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP107P57740 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP107P57740 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP107P57740 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP107P57740 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP107P57740 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP107P57740 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP107P57740 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP107P57740 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP107P57740 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP107P57740 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP107P57740 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP107P57740 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP107P57740 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP107P57740 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP107P57740 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP107P57740 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP107P57740 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NUP107P57740 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NUP107P57740 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NUP107P57740 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP107P57740 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP107P57740 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP107P57740 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP107P57740 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP107P57740 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP107P57740 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP107P57740 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP107P57740 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP107P57740 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP107P57740 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP107P57740 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP107P57740 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP107P57740 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP107P57740 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP107P57740 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP107P57740 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP107P57740 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP107P57740 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP107P57740 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP107P57740 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP107P57740 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP107P57740 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP107P57740 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP107P57740 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP107P57740 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP107P57740 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP107P57740 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP107P57740 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP107P57740 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP107P57740 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP107P57740 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP107P57740 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP107P57740 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP107P57740 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP107P57740 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP107P57740 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP107P57740 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP107P57740 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP107P57740 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms