Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RIPK4P57078 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms