Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF10P55107 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF10P55107 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF10P55107 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF10P55107 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF10P55107 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF10P55107 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF10P55107 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF10P55107 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF10P55107 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF10P55107 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF10P55107 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF10P55107 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF10P55107 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF10P55107 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF10P55107 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF10P55107 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF10P55107 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF10P55107 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF10P55107 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDF10P55107 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDF10P55107 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDF10P55107 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GDF10P55107 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GDF10P55107 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDF10P55107 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDF10P55107 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GDF10P55107 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GDF10P55107 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GDF10P55107 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDF10P55107 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDF10P55107 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GDF10P55107 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDF10P55107 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GDF10P55107 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GDF10P55107 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDF10P55107 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDF10P55107 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDF10P55107 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GDF10P55107 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GDF10P55107 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GDF10P55107 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GDF10P55107 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GDF10P55107 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDF10P55107 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDF10P55107 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDF10P55107 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GDF10P55107 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GDF10P55107 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDF10P55107 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GDF10P55107 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GDF10P55107 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDF10P55107 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF10P55107 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF10P55107 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF10P55107 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF10P55107 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF10P55107 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF10P55107 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF10P55107 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF10P55107 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF10P55107 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF10P55107 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF10P55107 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF10P55107 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF10P55107 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF10P55107 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF10P55107 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF10P55107 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF10P55107 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF10P55107 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF10P55107 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF10P55107 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF10P55107 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF10P55107 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF10P55107 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF10P55107 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF10P55107 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF10P55107 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF10P55107 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF10P55107 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF10P55107 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF10P55107 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF10P55107 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF10P55107 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF10P55107 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF10P55107 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF10P55107 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF10P55107 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF10P55107 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF10P55107 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF10P55107 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF10P55107 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF10P55107 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF10P55107 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF10P55107 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF10P55107 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF10P55107 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF10P55107 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF10P55107 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms