Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD4P55036 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD4P55036 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD4P55036 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD4P55036 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD4P55036 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD4P55036 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD4P55036 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD4P55036 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD4P55036 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PSMD4P55036 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PSMD4P55036 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PSMD4P55036 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD4P55036 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms