Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORCP51449 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORCP51449 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORCP51449 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORCP51449 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORCP51449 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RORCP51449 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RORCP51449 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RORCP51449 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RORCP51449 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RORCP51449 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RORCP51449 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RORCP51449 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RORCP51449 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RORCP51449 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RORCP51449 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RORCP51449 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RORCP51449 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RORCP51449 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RORCP51449 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RORCP51449 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RORCP51449 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RORCP51449 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RORCP51449 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RORCP51449 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RORCP51449 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RORCP51449 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RORCP51449 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RORCP51449 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RORCP51449 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RORCP51449 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RORCP51449 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RORCP51449 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RORCP51449 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RORCP51449 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RORCP51449 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RORCP51449 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RORCP51449 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RORCP51449 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RORCP51449 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RORCP51449 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RORCP51449 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RORCP51449 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RORCP51449 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RORCP51449 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RORCP51449 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RORCP51449 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RORCP51449 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RORCP51449 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RORCP51449 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RORCP51449 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RORCP51449 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms