Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms