Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TTPAP49638 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTPAP49638 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTPAP49638 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTPAP49638 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTPAP49638 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTPAP49638 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTPAP49638 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TTPAP49638 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTPAP49638 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTPAP49638 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTPAP49638 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTPAP49638 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTPAP49638 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTPAP49638 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTPAP49638 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TTPAP49638 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTPAP49638 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTPAP49638 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTPAP49638 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTPAP49638 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTPAP49638 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TTPAP49638 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTPAP49638 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TTPAP49638 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTPAP49638 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTPAP49638 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTPAP49638 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTPAP49638 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTPAP49638 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTPAP49638 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTPAP49638 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTPAP49638 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTPAP49638 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTPAP49638 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTPAP49638 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTPAP49638 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTPAP49638 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TTPAP49638 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTPAP49638 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTPAP49638 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTPAP49638 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTPAP49638 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTPAP49638 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TTPAP49638 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TTPAP49638 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTPAP49638 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTPAP49638 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TTPAP49638 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TTPAP49638 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TTPAP49638 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTPAP49638 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTPAP49638 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTPAP49638 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTPAP49638 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTPAP49638 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTPAP49638 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTPAP49638 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTPAP49638 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TTPAP49638 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TTPAP49638 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTPAP49638 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTPAP49638 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTPAP49638 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTPAP49638 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTPAP49638 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTPAP49638 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTPAP49638 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTPAP49638 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTPAP49638 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTPAP49638 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TTPAP49638 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TTPAP49638 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTPAP49638 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTPAP49638 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTPAP49638 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTPAP49638 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTPAP49638 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTPAP49638 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTPAP49638 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTPAP49638 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTPAP49638 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TTPAP49638 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTPAP49638 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTPAP49638 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTPAP49638 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTPAP49638 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTPAP49638 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTPAP49638 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTPAP49638 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTPAP49638 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTPAP49638 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTPAP49638 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TTPAP49638 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTPAP49638 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTPAP49638 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTPAP49638 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTPAP49638 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTPAP49638 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTPAP49638 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
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