Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms