Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARGP37231 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARGP37231 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARGP37231 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARGP37231 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARGP37231 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARGP37231 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARGP37231 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARGP37231 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARGP37231 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARGP37231 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARGP37231 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARGP37231 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARGP37231 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARGP37231 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARGP37231 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARGP37231 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARGP37231 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARGP37231 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARGP37231 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARGP37231 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARGP37231 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARGP37231 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARGP37231 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARGP37231 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARGP37231 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARGP37231 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARGP37231 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARGP37231 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARGP37231 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPARGP37231 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPARGP37231 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPARGP37231 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPARGP37231 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPARGP37231 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPARGP37231 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPARGP37231 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPARGP37231 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPARGP37231 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPARGP37231 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPARGP37231 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPARGP37231 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPARGP37231 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPARGP37231 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPARGP37231 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPARGP37231 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPARGP37231 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPARGP37231 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPARGP37231 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PPARGP37231 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PPARGP37231 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PPARGP37231 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PPARGP37231 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPARGP37231 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPARGP37231 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPARGP37231 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPARGP37231 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPARGP37231 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPARGP37231 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPARGP37231 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPARGP37231 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPARGP37231 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PPARGP37231 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPARGP37231 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPARGP37231 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPARGP37231 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPARGP37231 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPARGP37231 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPARGP37231 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPARGP37231 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPARGP37231 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPARGP37231 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPARGP37231 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPARGP37231 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPARGP37231 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPARGP37231 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPARGP37231 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PPARGP37231 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPARGP37231 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPARGP37231 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPARGP37231 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPARGP37231 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPARGP37231 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPARGP37231 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPARGP37231 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PPARGP37231 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPARGP37231 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPARGP37231 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPARGP37231 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPARGP37231 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPARGP37231 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPARGP37231 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPARGP37231 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPARGP37231 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPARGP37231 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPARGP37231 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPARGP37231 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPARGP37231 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PPARGP37231 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPARGP37231 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms