Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms