Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms