Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
PLNP26678 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PLNP26678 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms