Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms