Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP4AP20648 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP4AP20648 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP4AP20648 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP4AP20648 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP4AP20648 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP4AP20648 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP4AP20648 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP4AP20648 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP4AP20648 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP4AP20648 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP4AP20648 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.8 ms