Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 AL079304.1-201ENST00000554595 828 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 AC133485.6-201ENST00000624045 688 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms