Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms