Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC166P0CW27 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms