Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TYMSP04818 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TYMSP04818 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TYMSP04818 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TYMSP04818 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TYMSP04818 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TYMSP04818 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TYMSP04818 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TYMSP04818 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TYMSP04818 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TYMSP04818 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TYMSP04818 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TYMSP04818 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TYMSP04818 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TYMSP04818 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TYMSP04818 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TYMSP04818 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TYMSP04818 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms