Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TK1P04183 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TK1P04183 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TK1P04183 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TK1P04183 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TK1P04183 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TK1P04183 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TK1P04183 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TK1P04183 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TK1P04183 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TK1P04183 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TK1P04183 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TK1P04183 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TK1P04183 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TK1P04183 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TK1P04183 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TK1P04183 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TK1P04183 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TK1P04183 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TK1P04183 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TK1P04183 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TK1P04183 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TK1P04183 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TK1P04183 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TK1P04183 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TK1P04183 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TK1P04183 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TK1P04183 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TK1P04183 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TK1P04183 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TK1P04183 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TK1P04183 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TK1P04183 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TK1P04183 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TK1P04183 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TK1P04183 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TK1P04183 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TK1P04183 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TK1P04183 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TK1P04183 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TK1P04183 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TK1P04183 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TK1P04183 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TK1P04183 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TK1P04183 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TK1P04183 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TK1P04183 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TK1P04183 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TK1P04183 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TK1P04183 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TK1P04183 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TK1P04183 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TK1P04183 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TK1P04183 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TK1P04183 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TK1P04183 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TK1P04183 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TK1P04183 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TK1P04183 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TK1P04183 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TK1P04183 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TK1P04183 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TK1P04183 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TK1P04183 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
TK1P04183 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TK1P04183 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TK1P04183 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TK1P04183 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TK1P04183 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TK1P04183 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TK1P04183 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
TK1P04183 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TK1P04183 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TK1P04183 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TK1P04183 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TK1P04183 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms