Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZBED1O96006 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms