Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms